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(統合計算化学システム)MOE【株式会社モルシス】


MOE(Molecular Operating Environment)は、低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、および核酸などの多様な創薬モダリティに対応した分子設計とモデリングソフトウェアです。多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツを搭載しており、計算科学者だけでなく、合成研究者、バイオロジスト、X線結晶構造解析者などの研究活動を強力に支援します。 グラフィックス、コマンドライン、ウェブアプリケーション、ワークフローの各種使用モードと柔軟なカスタマイズにより、ユーザーの研究目的にあわせて最適な分子モデリング環境を構築できます。


3Dグラフィックス

  • ユーザーフレンドリーなグラフィカルユーザーインターフェース

  • 非結合相互作用の可視化

  • 高品質な画像と動画

  • GPU アクセラレーション 3D ステレオ グラフィックス

  • 複合仮想現実と3Dプリント




Structure-Based Design

  • 活性部位の検出と解析

  • ポケット内でのリガンド設計

  • タンパク質-リガンド相互作用図

  • ウォーターサイトとエネルギーの予測

  • 誘導フィットドッキング

  • フラグメントのリンク、伸長、置換






抗体と生物学的製剤の設計

  • 立体構造に基づくタンパク質工学

  • 開発可能性と問題を引き起こす可能性(liability)の評価

  • 親和性、安定性、溶解度の最適化

  • ハイスループット抗体モデリング

  • バーチャルライブラリの生成

  • タンパク質ータンパク質ドッキングとエピトープマッピング




MOEsaic - SAR解析

  • SARとSPRの可視化

  • Free-Wilson法による化合物の提案

  • Matched Molecular Pairs(MMP)解析

  • 置換基解析とプロファイリング

  • 部分構造および類似構造検索

  • 新規仮想化合物の設計





Ligand-Based Design

  • 配座の生成とクラスタリング

  • 低分子のアラインメントと重ね合わせ

  • ファーマコフォア解析とスクリーニング

  • コンビナトリアルライブラリーの生成







タンパク質、核酸モデリング

  • タンパク質とその相互作用残基、および特徴的分子表面の可視化

  • アミノ酸配列からのタンパク質立体構造予測

  • DNA/RNAモデルの構築

  • 突然変異体と側鎖配座の探索

  • 分子動力学シミュレーション

  • ループ/リンカー探索とサンプリング

  • タンパク質-タンパク質ドッキング



バーチャルスクリーニング

  • 3Dファーマコフォアスクリーニング

  • 特徴と形状による束縛条件

  • 低分子ドッキング

  • 2Dおよび3Dフィンガープリントスクリーニング

  • 高速な配座解析データベース構築

  • 化学反応ベースのライブラリー設計




Fragment-Based Design

  • 母核置換

  • フラグメントの連結および伸長

  • メディシナルケミストリー変換

  • リガンド・ハイブリダイゼーション(BREED)

  • フラグメント・ライブラリー





構造バイオインフォマティクス


  • マルチ配列、および構造アラインメント

  • 3D構造ベースのアミノ酸配列アノテーション

  • タンパク質ファミリーデータベースの構築と検索

  • 構造データマイニング





分子シミュレーション

  • 分子力学計算、および分子動力学計算

  • 分子系の前処理の自動化

  • 自由エネルギー計算

  • 複数分子のフレキシブルアラインメント

  • 配座解析 ーLowModeMDー

  • 2面角のスキャンと解析

  • QMベースのMNR、IR、およびVCDスペクトル




ペプチドモデリング


  • 大環状、および線形ペプチド

  • ペプチドータンパク質相互作用の同定

  • 配座解析

  • 非天然ペプチドライブラリの網羅的生成

  • 立体構造に基づくペプチド設計

  • ペプチドのプロパティの最適化

  • ペプチドドッキング




構造生物学

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  • 電子密度、および差異マップの描画

  • 結晶格子と結晶構造における原子接触の可視化

  • 水分子の位置の予測

  • 電子密度誘導ドッキング

  • タンパク質ファミリーのアラインメントデータベース

  • 分子置換のためのホモロジーモデリング

タンパク質立体構造の妥当性の検証



ケモインフォマティクスとQSAR

  • 400以上の2Dおよび3D分子記述子

  • pKaの予測と水素付加状態の網羅的生成

  • 線形QSAR/QSPRモデル構築

  • ベイジアン分類モデル

  • 化合物の類似性、ダイバーシティ、およびクラスタリング





カスタマイズと開発環境

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  • ラップトップ - クラスターマシン - クラウドコンピューティング - ワークフロー

  • Windows - Linux - macOS

  • 統合型開発環境(SVL - Scientific Vector Language)

  • サードパーティソフトウェアの統合

  • カスタムアプリケーション

  • ウェブ統合、ウェブサービス、およびAPI



PSILO - タンパク質立体構造データベース

  • ウェブブラウザインターフェース - 3D分子構造表示

  • プロジェクトデータベースの自動キュレーション

  • 3D相互作用検索と統計解析

  • ポケット類似性検索

  • タンパク質立体構造の重ね合わせ


開発元について

開発元であるCCG社のホームページ及びビデオライブラリーもご覧ください。開発元であるCCG社のホームページ及びビデオライブラリーもご覧ください。



※各メーカー様の商品ページ内容を記載しております。

変更になる場合もありますので各メーカ様のサイトをご確認ください。


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